Berühmter Gelehrter seiner Zeit, Leibarzt des französichen Königs Heinrich 11., Verfasser mehrerer einst vielgelesener Werke über das Astrolabium, Vermessungswesen und Heilkunde. Hier bemühte er sich vor allem um die Analyse übernatürlicher Einflüsse auf die menschliche Gesundheit; sein Werk »De abditis rerum causis« wurde unter anderem von Bodin zitiert, um dadurch die Ansicht über die Möglichkeit dämonischer Einflussnahme auf den Menschen zu rechtfertigen. Fernel erklärt zum Beispiel die Epidemien als durch Dämonen hervorgerufene »okkulte« Krankheiten, die mit göttliche Zulassung auch von Zauberern herbeigerufen werden können, und gegen sie seien daher nicht natürliche, sondern geistliche Heilmittel anzuwenden.