Ebenso Halbedelsteine und seltene Mineralien spielten in der Magie seit den Babyloniern eine grosse Rolle, und zwar als Konzentrat kosmischer Kräfte, das dauerhafter und unvergänglicher ist als etwa magisch wirkende Pflanzen. Aus der Antike sind mehrere Quellen erhalten: das Steinbuch des Theophrastos, um 200 vor Christus, das »Orphische Steinbuch«, die Kompilation eines Lapidars, das unter dem Namen »Damigeron« bekannt ist; das Steinbuch des Aetios von Amida, des Leibarztes Justinians; die Steinbücher von Epiphanios und von Michael Psellos und ähnliche Quellen.
Paracelsus bezeichnete die Edelsteine als die »höchste Subtilität der Natur« und teilte die Mineralien in seinem Traktat »de mineralibus« in Salia, Mineralia, Lapides, des weiteren in Gemmen und Gluten ein. Cardanus schrieb, die Edelsteine seien wunderkräftiger und mächtiger als die Stoffe pflanzlichen und tierischen Ursprungs, weil sie höheres Alter und »weniger Funktionen« besässen. Jeder schön geschliffene Stein besitze die Macht, Liebe, Reichtum und langes Leben zu bewirken. Bekannte Lapidarien aus der neueren Zeit sind jene von de Boot und Swedenborg. Gegen Ende des 18.Jahrhunderts war der Glaube an die magische Wirksamkeit der Edelsteine bereits weitgehend geschwunden. K. von Eckartshausen berichtet in seinen »Aufschlüssen zur Magie«, München 1788: »Die Wunderdinge, die Alten davon erzählten, bestätigten sich selten durch bewährte Versuche. Albertus Magnus und Albertus Parvus schrieben sehr viele lügenhafte Sachen von den Steinen«, etc., doch führt er im Anschluss eine Liste jener Edelsteine an, die in magischen Büchern eine Rolle spielten: »Adamas, Achates, Alectorius, Amethystus, Androdamas, Absinthos, Asbestos, Alabandina, Berillus, Carbunculus, Chrysolithus, Chrysopras, Chrysoprasius, Chelidonius, Carneolus, Calcophonos, Chrysolectros, Chalazias, Chelonites, Corallium, Chalcedonius, Cerauneus, Cristallus, Diadochos, Dionysias, Etites, Enhidros, Gagates, Gagatromeus, Galactites, Hieracites, Hienia, Heliotropia, Hephestites, Hematites, Hexeconthalithos, Hyacinthus, Jaspis, Iris, Lyncurius, Lipares, Magnes, Molochites, Medus, Onix, Orites, Ophtalmius, Pantherus, Pyrites, Peanites, Prasius, Saphirus, Smaragdus, Sardius, Sardonix, Selenites, Sagda, Topazius, Tecolitus, Unio.« Eckartshausen zitiert dazu Angaben aus Solinus, Bartholomaeus Anglicus, Aristoteles, Dioskurides, Isidorus, Vincentius Bellovacensis, Avicenna.
Die den einzelnen Edelsteinen zugeschriebenen Kräfte werden von der Spätantike bis in die Neuzeit weitgehend identisch beschrieben: der Diamant etwa soll die Kraft haben, Gespenster zu verscheuchen, Gunst bei Frauen zu verschaffen, auch hieb- und stichfest zu machen und Unsichtbarkeit zu verleihen. Böse Geister fliehen auch den Bernstein, den Jaspis und den Chrysolith, der Amethyst hilft gegen Ungewitter und Trunkenheit; die Koralle verwandelt bitteres Wasser in süsses, schützt gegen Gift und verscheucht Dämonen. Der Nephrit vertreibt Schlangen und macht bei Frauen beliebt; der Rubin bewahrt vor Schiffbruch. Stürme und Ungewitter vertreibt der Smaragd, die Seekrankheit der Topas, welcher auch reichen Gewinn beim Handel bringt; der Opal verscheucht quälende Träume usw. Als besonders wirkungsvoll wurden die Edelsteine dann betrachtet, wenn sie durch die Kunst des Goldschmiedes in Amulette und Talismane eingesetzt waren. Das komplizierte System der kosmischen Entsprechungen bzw., Sympathien machte die Zusammenstellung von Tabellen nötig, worin die Korrespondenzen zwischen Edelsteinen einerseits und 1 Planeten und Zeichen des Zodiakus andererseits registriert waren: so entspricht etwa der Rubin der Sonne und dem Tierkreiszeichen Leo.