Geboren als Edward Talbot; englischer Totenbeschwörer, Alchimist und Wissenschaftler, der 1582 Assistent bei dem berühmten elisabethanischen Gelehrten Dr. John Dee wurde. Allgemein als Scharlatan angesehen, teilte Kelly dennoch Dees intellektuelles Interesse am Okkultismus.
Kelly wurde in Worcester geboren, wo er bei einem Drogisten eine Zeitlang als Praktikant arbeitete. Dem Vernehmen nach machte er zusammen mit einem Paul Waring auf dem Friedhof in Walton-in-le-dale, in Lancashire, einen ersten Versuch, Tote zu beschwören. Die beiden Männer gruben eine frisch bestattete Leiche aus und brachten sie durch verschiedene Beschwörungen angeblich zum Sprechen. Die Szene wurde dann im siebzehnten Jahrhundert zum Gegenstand einer berühmten Druckschrift, in der beide Männer in einem schützenden magischen Kreis stehen und ein Knochengerippe im Totenhemd befragen.
Kelly fühlte sich berufen, John Dees Bekanntschaft zu machen. Später deutete er an, in dessen Haus in Mortlake geschickt worden zu sein, um Beweise dafür zu beschaffen, dass Dee Umgang mit dem Teufel habe, mit denen ein Prozess gegen den Gelehrten angestrengt werden sollte. Dee lernte bald Kellys Fähigkeit des Kristallsehens zu schätzen, und die beiden Männer wurden auf der Suche nach Wissen über die mystischen Künste Partner. Kelly berichtete Dee Details über die Geisterwelt, die er beim Kristallsehen herausgefunden hatte, und erzählte ihm fast täglich von seinen Unterhaltungen mit Engeln.
Einer der Gesprächspartner der beiden Männer war der heilige Michael, der Kelly mit seiner Forderung erschreckte, er möge sich eine Frau nehmen, was er - seinen Worten zufolge mit grösstem Widerstreben - auch bald darauf tat. Die Neuvermählten zogen in Dees Haus ein, was einige Misshelligkeiten mit sich brachte, doch die Arbeit ging weiter. Die beiden Männer besuchten zusammen mit ihren Frauen die europäischen Herrscherhöfe, wo sie allgemein als Gelehrte und Mystiker geehrt wurden. Kelly soll bei den Aufenthalten im Ausland seine Kenntnisse der Alchimie vervollkommnet und bei seinen Experimenten echtes Gold erzeugt haben. Für diese und andere Leistungen wurde er während seines Aufenthalts in Prag von Kaiser Rudolf 11. in den Ritterstand erhoben.
Die absonderlichste Episode in Kellys Beziehung zu Dee ereignete sich 1587; sie brachte das Ende der gerühmten Zusammenarbeit. Als Kelly berichtete, ein Kommunikationspartner aus der Geisterwelt namens Madini habe gefordert, dass die beiden Männer und ihre Ehefrauen eine Vereinbarung über gemeinsame eheliche Beziehungen treffen sollten, herrschte Bestürzung im Haus. Schliesslich unterzeichneten alle vier den Vertrag - der Dees junge und schöne Frau Jane nun für Kelly erreichbar machte. Die privaten Spannungen, die sich aus einer solchen Übereinkunft ergeben mussten, führten dazu, dass sich etwa zwei Jahre später die Wege der Beteiligten trennten.
Nach seinem Bruch mit Deen im Jahre 1589 kehrte Kelly nach Prag zurück, wurde dort jedoch für mehrere Monate ins Gefängnis gesteckt, nachdem man ihn der Verschwörung gegen den Kaiser angeklagt hatte. Nach seiner Freilassung, die er dem Eingreifen Elisabeths I. verdankte, zog er nordwärts nach Deutschland, wurde jedoch erneut als Zauberer verhaftet. 1593 sprang er bei einem Fluchtversuch von einer Mauer und zog sich innere Verletzungen zu, denen er zwei Jahre später erlag.