Griechische Siedlung am kanopischen Nilarm im West-Delta, nur etwa 16 km von Sais entfernt. Sais war die Hauptstadt der 26. Dynastie, unter der Naukratis neu organisiert wurde. Der heutige Name der Stadt selbst lautet Kom Giaeif, der antike Name scheint indes in dem Namen des nahe gelegenen Dorfes el-Niqrasch erhalten zu sein.
Dem griech. Historiker Herodot zufolge erhielten die Griechen den Ort von Amasis (570-526 v. Chr.) zusammen mit einem Monopol auf den Seehandel nach Ägypten zugesprochen. Allerdings ist es wahrscheinlich, dass Amasis einfach eine bestehende Ansiedlung von Ausländern neu organisierte und ihnen neue Handelsprivilegien verlieh. Aus Funden wie korinthischer Keramik des sog. Übergangstils geht hervor, dass die griech. Siedlung an diesem Ort etwa auf das Jahr 630 v. Chr. zurückgeht. Steuer- und Zolleinnahmen gingen an den Tempel der Neith in Sais.
Die ersten Griechen in Naukratis waren offenbar Korinther, den grössten Einfluss in der Saitenzeit erlangten jedoch - neben einigen anderen Gruppen - die Milesier. Diese verschiedenen griechischen Gemeinschaften errichteten sich mit dem Hellenion einen gemeinsamen heiligen Bezirk. Es gab mehrere Tempel, die verschiedenen Gottheiten geweiht waren, u. a. der Aphrodite von Chios, der Hera von Samos (deren Name wir von Votivkeramik kennen) und dem Apollon von Milet.
Bei der Ausgrabung der Stadt durch Flinders Petrie in den Jahren 1884-85 war sie bereits in schlechtem Zustand. Später wurde sie von F. Ll. Griffith und D. G. Hogart sowie - in den 80er Jahren des 20. Jh. - von einem amerikanischen Archäologenteam untersucht. Im südlichen Teil der Stadt entdeckte Petrie eine Fayence-Werkstätte, in der so typisch ägytische Dinge wie Skarabäen, aber auch griech. und ägyptisierende Erzeugnisse hergestellt wurden. Belege für die Herstellung von Keramik fand man in Naukratis ebenfalls.
Silber- und Bronzemünzen - die einzigen Münzen, die aus dem pharaonischen Ägypten bekannt sind - wurden in Naukratis geprägt, und wahrscheinlich sind anderswo in der griechischen Welt geprägte Münzen über diese bedeutende Siedlung nach Ägypten gelangt. Unter den Ptolemäern verlor Naukratis gegenüber Alexandria an Bedeutung.